SISEX SA appartiene in parti eguali alle due società concessionarie: la Società Italiana per il Traforo del Gran San Bernardo (SITRASB SpA) di St-Rhémy-en-Bosses (IT) e alla Société Tunnel du Grand-Saint-Bernard SA (TGSB SA) di Bourg-Saint-Pierre (CH).
La funzione operativa di SISEX SA è sopratutto commerciale. SISEX SA gestisce la ripartizione degli incassi tra le due società concessionarie. Inoltre ha competenze specifiche in materia di politiche tariffarie e promozionali.
Dal 1° gennaio 2006, con una convenzione con le due società concessionarie, SISEX SA assume anche un importante ruolo di coordinamento e di controllo delle attività comuni (sicurezza, gestione, investimenti).